顯微拉曼光譜儀配置更加靈活，使用更加簡單，自動化程度更高。它可根據自己的需求選擇不同的功能模塊，及相應的自動化程度。目前，所有的顯微拉曼光譜儀把具有較高的靈敏度作為標準，將配置靈活和高靈敏度集中于同一套拉曼光譜儀上。
顯微拉曼光譜儀的原理：
顯微拉曼光譜儀是將拉曼光譜分析技術與顯微分析技術結合起來的一種應用設備。拉曼光譜屬于分子振動光譜，每種物質的拉曼線可以有若干隊，每對線對應于物質的兩個能級間差值（振動、轉動或電子能量間的差值），所以能從分子水平上反映樣品化學組成和分子結構上的差異。
顯微拉曼光譜儀可將激發光的光斑聚焦到微米量級，進而對樣品的微區進行精確分析，激光在樣品上產生作用的確切部位，可以通過CCD鑒定儀和一個TV監視儀，清晰地顯示出來，TV屏幕，可以選擇有關分析所感興趣的任何樣品的任意部位，整個分析鑒定過程，都非常直觀，易于進行觀察和控制。這對于腫瘤細胞間細微差異的檢測、文物考古中的痕量物質分析等而言，是一個十分理想的手段。
顯微拉曼光譜儀的應用：
分子在振動的時候會引起分子極化率的變化，從而會產生拉曼光譜，如果要對拉曼光譜進行觀察和分析就需要使用專業的顯微拉曼光譜儀，共聚焦顯微拉曼光譜儀具有很好的空間分辨率，利用顯微拉曼光譜儀可以得到樣品體積很小和不同深度的光譜信息。顯微拉曼的應用領域十分廣闊，那么顯微拉曼光譜儀究竟可以用來觀察什么呢?
1、觀察分析拉曼位移：
拉曼位移是散射光頻率和激發光之差，因為拉曼位移只取決于散射分子的結構，所以，拉曼光譜可以作為分子振動能級的指紋光譜，而拉曼光譜的橫坐標則為拉曼位移。在進行觀察分析的時候，可以使用顯微拉曼光譜儀來對拉曼位移進行觀察，從而鑒定出材料分子的特性。
2、觀察檢測細胞中的蛋白質：
由于拉曼光譜可以避免水的干擾，對各種生物組織能做原位檢測，基于此，顯微拉曼光譜儀能夠檢測單個完整細胞當中的蛋白質，在做檢測的時候，顯微拉曼光譜儀可以在表皮下幾百微米的地方獲得細胞的組成信息，從而對完整細胞當中的蛋白質進行快速而且無損的檢測。
3、觀察分析微區和表面：
顯微拉曼光譜儀可以對樣品的微區和表面進行良好的分析。由于顯微拉曼光譜儀在觀察分析的時候可以獲得樣品微區分子的振動信息，從而得到相關的分子信息，此外，顯微拉曼光譜儀的分辨率很高，而且在分析的時候也是十分快速簡便的，所以能夠有效分析微量樣品的微區和表面。
